第六季主要讲述了瑞克一伙人在亚历山大社区的生存状况，以及遇到大反派尼根并陷入了前所未有的困境。
瑞克（安德鲁·林肯饰）是亚特兰大城郊一座小镇的副警长。在执行公务的过程中，瑞克遭到枪击，伤势严重，被人紧急送往当地医院进行抢救。当瑞克醒来之后，发现医院里已经空无一人。他意识到外面一定出了大事，但又不清楚到底是什么事。当第六季开始时，瑞克接受了自己的"领袖"地位，现在他自己和其他人也都这么看待他。他并不想要这种地位，但是他也不会拒绝。他已经完全认可了现实的残酷，他必须以残酷来对待残酷，即便犯下罪恶。只有这样，他才能当一个父亲、一个朋友，才能带领大家一直抗争下去。
行尸大军危及社区许多事情，只有亲自去探索，才会发现更多意想不到的真相。瑞克一行人离开社区，发现数不胜数的行尸被困在一处山窝中。放眼看去，行尸密密麻麻如同一片海洋，大部份集中在山窝里面，少部份顺着山窝往上走动，在半山坡被几辆厢式货车挡住。整个山坡如同一个大锅，行尸大军想离开山坡，除非突破半山坡的货车，否则将会一直被困在山窝中。
数以万计的行尸发出咆哮声，响彻云霄气吞山河，瑞克一行人居高临下立于坡上，计划消灭所有行尸。社区原本祥和的局面被皮特打破，皮特杀害了迪安娜的丈夫雷吉，瑞克征得迪安娜许可击毙了皮特。
塔拉曾在一次执行任务中身受重伤，胆小怕事的尤金发挥出惊人的潜能，只身一人将昏迷不醒的塔拉救出重围。经过数日休养，塔拉苏醒过来恢复健康，与尤金相视而笑，尤金已经成为塔拉的救命恩人，两人之间的距离更近一步。瑞克向所有社区成员讲述当下面临的风险，距离社区不远的山窝中有数以千计的行尸，一旦阻拦行尸的厢式货车翻倒，行尸大军便会如同决堤的洪水涌向社区。
卡特认为瑞克在威言耸听，自从目睹瑞克枪杀皮特，卡特对瑞克充满敌意，对于瑞克提出的诱杀大量行尸方案，卡特持反对意见，他认为待在社区里面不去招惹行尸才是明智之举。卡特与几个同伴商量除掉瑞克夺回大权，尤金凑巧在隔墙偷听，因心中紧张造出声响被卡特发现，眼看尤金命将不保，瑞克及时出现制服了卡特，做事一向果敢绝决的他没有立即开枪，在达里尔的提醒下放过卡特。
瑞克虽然饶过卡特一命，死神却降临到了卡特身上。他在跟随众人执行任务的过程中被行尸咬伤脸部，已经回天无力，死在瑞克的手上。瑞克自认杀害卡特无可厚非，叮嘱本想隐瞒此事的摩根返回社区，将事发经过告诉给所有成员。大量行尸顺着公路向前缓慢行走，社区方向忽然传来刺耳的喇叭声，行尸大军被喇叭声吸引，转移路线横穿树林，潮水一般往社区方向走去。
