马尔堡病毒发病迅速、致死率极高，往往会出现一些严重的并发症。比如失血性休克、水电解质紊乱、肝功肾功衰竭、心力衰竭等。所以一旦诊断马尔堡病，需要立即给予相应的治疗。
在治疗方面，主要是对症治疗，减轻症状。比如输液，给予维持水电解质的平衡，控制出血。如果出现有出血，给予输注新鲜的血液，血小板减少，可以给予输入血小板，如果出现了肾衰竭，要控制入夜量，给予利尿剂。如果出现了有心力衰竭，要给予强心药，如果出现了肝衰竭，要给予保肝的药物等。
