皮肤癣菌以外的丝状霉菌简称为“霉菌”，这是一类条件致病性真菌或污染真菌。霉菌所致的灰指甲发生率远远低于皮肤癣菌和酵母菌，但是，近几年来霉菌的致病率在逐渐上升中。因此，霉菌作为引发灰指甲的其中一类真菌，也应当引起人们的关注和重视。
1.霉菌感染的地理因素
由霉菌引起的甲真菌病（灰指甲）发生率也因地理位置而异，如热带和亚热带国家的灰指甲主要致病菌就是是柱顶孢霉。柱顶孢霉在土壤中广泛分布，是热带及亚热带地区的植物尤其是果树的致病真菌，由风吹散传播孢子，所以，柱顶孢霉所致的灰指甲病例也仅限于热带及亚热带地区。由于我国南方大部分地区都位于亚热带，涉及的省市自治区较为广泛，人口也占全国总人口的一半。
2.霉菌的感染机理
有些霉菌可以在原发地侵犯甲板，而大部分霉菌常常侵犯原本就已经损伤的甲板，并且常常表现为侵犯单个脚趾甲，多以大母脚趾为主，一般脚趾周围皮肤有损害。霉菌感染指（趾）甲时，很有可能在为其提供生存环境的宿主免疫机能存在缺陷，或有疾病时以及其它感染时引起甲母质的改变，这些留居在甲板上的霉菌便开始发挥它们本能的破坏作用。
