朱允炆不杀朱棣的原因有两个，第一是朱允炆不想杀，他从小接受严格的儒家教育，做不出亲手诛杀叔叔的事情，第二是朱允炆不能杀，朱棣胆识过人，实力强壮，担负着抵御侵略的重任，所以朱允炆不能轻易卸掉朱棣这条带有威胁性的臂膀。
朱允炆是朱元璋的孙子，也是朱棣的侄子，朱元璋在位期间就立朱允炆为皇太孙，之后朱允炆继承皇位，但是在他即位后总是受到叔叔朱棣的威胁，朱棣心系皇位，处处与朱允炆作对，但不得不说朱棣是有帝王之才的。
1399年朱棣发起靖难之役，他与朱允炆之间来了一场长达三年的抗衡对峙，最初朱棣不占优势，他打着清君侧的名号架空朱允炆的权力，朱棣有强大的领导能力，军队也都是出类拔萃的精英，所以朱允炆节节败退。
建文四年朱棣带领的燕君兵临城下，进行了一场混战，最终朱棣登上皇位，而朱允炆下落不明，这也是朱允炆心慈手软没有杀掉朱棣的结果。
