不育男子应作体格检查，一般检查包括身高、体重、两手伸平时的指距;观察第二性征发育情况，例如胡须、喉结、腋毛、阴毛的生长情况，有无男性乳房发育等。检查的重点是泌尿生殖系统。阴茎大小、是否有尿道下裂，睾丸大小、质地软硬度。触摸附睾有无增厚、触痛和囊肿。检查输精管及精索静脉。必要时肛诊检查前列腺的大小、质地，并按摩出前列腺液化验。
实验室检查中最重要而又简单易行的是精液质量检查。精液检查结果像一面镜子，许多引起不育的病因都会从中反映出来。如果检查结果显示精子数量、活动率及形态异常精子数等有异常，说明精液质量不正常，应重复检查2～3次。如果仍不正常，说明睾丸生精功能或附性腺出了毛病。精液的生化检查，例如果糖、酸性磷酸酶、锌、肉毒碱等，可以分别反映精囊、前列腺、附睾的功能。检查精子质量的方法还有精子爬高试验、性交后试验、精子穿透去透明带的地鼠卵试验等。检查精液和血液中是否存在抗精子抗体，需要做精子凝集试验，精子制动试验等。
此外，对于严重少精或无精子病人，需要作内分泌激素测定和药物刺激试验、染色体检查，必要时则需作输精管造影和睾丸活检等。
另外，对男性不育患者，了解病史有很重要的意义。曾有结婚多年，女方一直未孕。后在医生的详细询问病史时才了解到这对夫妇根本就没有正常的性生活，他们认为结婚以后，睡到一张床上互相拥抱、接吻等就会怀孕。后经医生指导，进行了正常的性生活后得到了满意的结果。从这对性盲夫妇的实例可以看出，婚姻史、性生活史在男性不育的诊疗过程中具有重要的意义。
