板蓝根味苦性寒，归心、胃、肝、胆经。功能清热解毒，凉血利咽。主治温毒所致的疾病，如流感、上呼吸道炎症、流脑、腮腺炎、急性肠炎、菌痢、肝炎、颜面丹毒、热病发斑等。虽然药理研究表明，板蓝根对多种病毒与病菌有明显的抑制作用，但不要忘记它是一味苦寒药物。所以，对于上述疾病，只有出现温热、热毒、湿热内盛证候时，才能使用。
少年儿童应该避免大剂量，长期服用板蓝根。辅仁板蓝根颗粒这样的抗病毒清热解毒药，本来毒副作用很小，但是用的时间长了，吃的数量多了，就会积“药”成疾，酿成后患。在临床中使用板蓝根冲剂造成小儿过敏反应、消化系统和造血系统损害的病例屡见不鲜。服用“板蓝根”等呼吸道疾病药物时，有过敏史者一定要注意不要轻易服用。
对于小儿，千万不能用成人剂量，更不能长期大剂量服用。如果在用药中发生了过敏反应，首先应立即停药，并迅速送往医院；如是上消化道出血，除立即停药外，还应禁食，并尽快送医院处置。感冒大多由病毒感染所致，中药板蓝根虽有抗病毒的作用，但中医学把感冒分为风寒型感冒和风热型感冒两大类，又由于季节的不同，感受外邪（致病因子）的不同，又有夹湿、夹暑、夹燥的不同，如果患感冒不分寒热、虚实和夹杂，一味用板蓝根治疗，是不科学的。
