药物1：免疫促进剂或激素类药物。这类药物在国外应用较广，可有效治疗某些深大、久治不愈的溃疡，并能抑制溃疡复发长达3-6个月。但激素长期应用可产生某些严重不良副作用。免疫促进剂也能降低溃疡的复发，如转移因子、胸腺肽等，但此类药物长期使用后疗效有可能降低。
药物2：新型生物制剂。这类药物是随着基因工程的迅猛发展而研究开发出来的新一类药物，分为免疫因子和生长因子两类。免疫因子对于免疫功能低下的患者如放化疗术后的口腔粘膜炎具有显著疗效。生长因子类制剂主要是直接刺激创面细胞分裂增殖，可在溃疡创面固定成膜，保护创面从而大大缓解患者疼痛，得到好评。
药物3：中药制剂。主要成分为冰片、青黛，多具有清热解毒、活血化淤、生肌止痛功效。成药有溃疡散、养阴生肌散、锡类散、西瓜霜喷剂和复方草珊瑚含片等。复合制剂。如溃疡膏、溃疡膜和复方金霉素药膜等，治疗效果确切。
另外，还有一种针对初发口腔溃疡时使用“三合一”法对付它有不错的效果：饭后先用食盐水漱口2次，漱口后隔1～2分钟，用清水漱口2遍，再取凉浓茶漱口1～3次，最后取维生素c（0.1克/片）1片，压碎成粉，用棉签蘸粉涂于溃疡表面，闭口片刻。以上方法早晚各一次，溃疡多在3天内痊愈。
