淋巴瘤的病因是大部分淋巴瘤患者和家属非常关心的问题，事实上，淋巴瘤的病因和发病机制至今不完全清楚，国内外学者主要偏重于病毒学、幽门螺杆菌、免疫功能异常等几个因素。
在Burkitt淋巴瘤患者中，80%以上的病人血清中EB病毒抗体滴定度明显增高，而非Burkitt淋巴瘤者滴定度增高者仅14%。滴定度高者发生Burkitt淋巴瘤的机会也明显增多。均提示EB病毒是Burkitt淋巴瘤的病因。EB病毒也可能是移植后淋巴瘤和AIDS相关淋巴瘤的病因。
70年代后期提出逆转录病毒与淋巴瘤发病有密切关系。日本发现成人T细胞淋巴瘤/白血病有明显的家庭集中趋势，且呈地区性流行。人类T细胞白血病/淋巴瘤病毒(HTLV1)被证明是这类T细胞淋巴瘤的病因(见白血病)。另一逆转录病毒HTLVⅡ近来被认为与T细胞皮肤淋巴瘤(蕈样肉芽肿病)的发病有关。Kaposi肉瘤病毒也被认为是原发于体腔的淋巴瘤(primary body cavity lymphoma)的病因。
胃粘膜低度淋巴瘤是一种B细胞粘膜相关的淋巴样组织淋巴瘤，幽门螺杆菌的存在与其发病有密切的关系，现考虑幽门螺杆菌是该淋巴瘤的病因。
患者的免疫功能也与淋巴瘤的发病有关。近年来发现遗传性或获得性免疫缺陷患者伴发淋巴瘤者较正常人为多;器官移植后长期应用免疫抑制剂而发生恶性肿瘤者，其中1/3为淋巴瘤。干燥综合征患者中淋巴瘤发病数比一般人为高。
