对这一类头痛的防治主要是针对原发病进行治疗。
如对眼源性头痛，应治疗并矫正屈光不正，养成良好的阅读习惯、少看电视，定期检查视力，勤做眼保健操，以及预防青光眼等。
对耳源性头痛，则要积极防治急性化脓性中耳炎，及时地使用足量、敏感的抗生素，控制炎症。
对鼻源性头痛，重点是防治鼻炎、副鼻窦炎，尤其是急性鼻窦炎，除口服或肌注抗生素，还可行鼻窦穿刺冲洗引流或抗生素局部注入。
对牙源性头痛者，则应首先治疗病牙，如及时填补龋齿，拔除残冠，治疗急性牙髓炎等等。
当上述原发病得到治疗后头痛就会缓解；原发病治愈后，头痛也可随之消失。
在原发病尚未彻底治愈时，如头痛严重，则可适当应用索密痛、罗通定、阿司匹林、消炎痛、扶他林、芬必得等止痛剂。若因头痛而影响睡眠，可适当服用镇静催眠剂，如安定、氯硝安定、舒乐安定等。
