1.内服药物治疗
常用的药物有斯皮仁诺胶囊、氟康哩胶囊等。其优点是有效。不足之处是疗程长，有的长达半年之久；另外有一定的机率对肝脏产生损害，在治疗前和治疗过程中要进行肝功能检查。
2.外用药物治疗
常用的药物有巴特芬溶液、达克宁霜等。有一定效果。但难深入指甲内部。
3.外科治疗
在局部麻醉下，拔除整个指甲。手术拔除效果好，但拔除多个指甲会对以后的生活、工作带来一定程度的不便。
4.自行用刀削后搽外用药
尽管此种方法不可取，但这是多数患者所采用的方法。灰指甲为霉菌感染所致，用刀并不能把霉菌剔除，而且这种方法有传播性。
5.物理治疗
二氧化碳激光为常用的治疗灰指甲的物理治疗，此法是用一束针尖大小的温度超过1000℃的激光，射到病甲之上，病甲立即碳化变黑·除去一层，再烧一层，一层一层地灼除，直到甲床。其优点为各种微生物，包括灰指甲的致病原--霉菌在内，激光所到之处，无一幸存。其不足之处是操作精细，需由专业医生进行。
