妊娠期常因一些合并症而必须用药治疗，只要做到合理用药，能够防止胎儿受母体疾病的影响。
如有人观察患重症结核的孕妇，用异烟肼、链霉素和对氨基水杨酸钠治疗后，可使新生儿营养不良的发生率比对照组下降一半，死产也有减少；患缺铁性贫血或糖尿病的孕妇，分别应用铁剂和胰岛素治疗，能减少胎儿和新生儿的病死率；
奎宁虽可引起流产、早产，但是当孕妇患疟疾须用此药时，用药后有时还可减少因疟疾引起的流产或死胎。
鉴于许多药物可以自由地通过胎盘，所以孕期用药应注意以下几点：
1） 没有一种药物对胎儿的发育是绝对安全的。
2） 只有药物对母亲的益处多于对胎儿的危险时才考虑在孕期用药，若有可能，在怀孕的前三个月应避免用任何药物。
3） 药物对胎儿的作用可能与预期发生在母亲身上的药理作用不同，如反应停曾作为抗早孕反应药，但可引起胎儿多肢体畸形。
4） 某些药物可能对胎儿有迟发的不良反应，如己烯雌酚可致阴道癌、泌尿生殖系统异常，大剂量应用时，可降低雌性后代的繁殖力。
5） 孕期药物代谢比非孕期明显减慢。
6） 致畸药如细胞毒性药物，只能给予那些采取可靠避孕措施的育龄妇女。
