马桶垫圈多数是共用的，如果家人患病，马桶垫圈就有可能成为传染途径。且棉质或化纤材质容易吸附空气中的灰尘或细菌，空气中含有少量白色念珠菌，积淀在马桶垫上，容易使女性患霉菌性阴道炎。
长时间不清洗的马桶垫圈还有可能滋生鞭毛虫，这是女性滴虫病的病原体。而男性小便时，或多或少地会将尿液溅在马桶垫圈上，所以马桶垫圈能不用尽量别用。如果老人或小孩一定要使用马桶垫圈的话，最好每隔3天清洗1次。如果家人身体健康，用肥皂清洗即可；若家中有生殖系统感染者，最好用84消毒液消毒。
