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导致胎儿畸形的原因一：滥用药物引起胎儿畸形。有些药物可通过胎盘进入胎儿体内，对胎儿产生不良影响，故妊娠期不能滥用药物。引起胎儿畸形的常用药物有：
1.抗生素，抗生素对胎儿的发育影响很大。
2. 激素类，妊娠早期服用过量的孕酮，或睾丸酮，可使女性胎儿男性化。
3. 催眠镇静剂，长期服用冬眠灵可致胎儿视网膜病变;眠尔通可致胎儿发育迟缓;苯巴比妥可抑制新生儿的呼吸及胃肠道张力，还可引起肝脏损害。孕期服用苯妥英钠可引起叶酸不足而致畸胎。
4.维生素a及叶酸缺乏可致胎儿畸形。如果孕妇吃了过量的维生素a也可引起胎儿骨骼畸形。
导致胎儿畸形的原因二：环境因素。
1. 放射线：孕早期尽可能不做腹部X线透视或摄片，否则有引起先天性心脏缺陷、小头畸形、死胎等危险。
2. 化学剂。
3. 感染因素：常见的是孕早期母亲患流感，单纯疱疹、风疹等病毒感染,可使胎儿患小头畸形及脑积水等组织或器官畸形。
导致胎儿畸形的原因三：孕妇本身营养不足，偏食、挑食、厌食或吸烟饮酒等都可引起胎儿畸形，遗传因素也可引起胎儿畸形，是指来自父母亲的遗传物质的异常而造成畸形的因素。
