月饼本身是高热量、添加多油脂的食品，由于用了各种馅料，因此糖分高、脂肪含量也高，部分还是高胆固醇，吃多了肯定不好，因此要控制好食用量。
老人和小孩吃月饼时，食用量不能太多，特别要注意切小块吃，以免噎着。除了晚上睡前，其他时间都可少量吃点，但一次不要超过1个。早晨人体的消化功能是比较弱的，月饼是高糖高脂食品，不利于消化，健康的年轻人偶尔一两次把月饼当早餐是没关系的，次数太频繁就不对了。
大部分糖尿病、肠胃功能较弱、三高心血管疾病等人群都明白月饼不能多吃，但平时没有症状的胆道疾病患者，中秋节日期间也更该保持饮食清淡，不要摄入过多油脂，否则慢性会转为急性。此外，对于心血管疾病患者来说，如果食用月饼过量，副作用可能不会马上体现出来，但存在潜在风险。
由于月饼本身已经是高油脂、高热量的食物，因此最好不要摄入热卡太高的饮料，如碳酸饮料、果汁等。吃月饼时应该选择有助消化的东西，如开水、清茶、花茶等。此外，品尝月饼时也不要吃冷饮，如啤酒、雪糕之类，容易造成恶心甚至腹泻等症状。
很多人也是直接将月饼放到冰箱里保鲜，想吃的时候再拿出来。王亦萍建议，月饼不宜放入冰箱储存，因为在低温的条件下，淀粉会变得老化，使月饼变硬、口感变差。储存月饼最好放置在室内阴凉干燥处，要注意储存时间不要太长，散装月饼可以放置三五天;有独立小包装，或包装中有防腐料包的月饼，可以保存十几天，最迟不要超过一个月。
