脂肪肝的临床表现多无症状，多数患者都是在健康体检上面发现的。也有部分患者有症状，表现为乏力，精神减退、恶心等。这些症状说明脂肪肝是比较严重的，可能还会诱发其他疾病。
不同病因所致脂肪性肝病，其病程和预后有所不同。非酒精性脂肪肝病程相对较长，一般呈良性经过，但有30%左右病例会发展成脂肪性肝炎，而后者的15%～50%有肝纤维化，7%～25%可发展为硬化。酒精性脂肪肝如能戒酒，预后也良好，在1月或数月后肝内脂肪可逐渐消退，但是如果持续饮酒，可在数年内出现肝硬化。如得不到有效治疗，脂肪肝发生纤维化的发生率高达25%，约1.5%～8.0%的患者可进展为肝硬化。一旦发展为肝硬化，其预后与一般的肝硬化相同。
脂肪肝本身与肝癌并无直接关系，但脂肪肝的病因之一（酒精）及其所致的肝硬化与肝癌有一定的关系。据西方国家统计，脂肪性肝病可使50岁以下患者的寿命缩短4年，使50岁以上患者的寿命缩短10年。
