一般医生会在严格掌握和了解病情之后，根据适应证和禁忌证的要求来决定的。主要适应证有：
1、不明原因的血尿，排除为非肾小球源性血尿。
2、不明原因而持续的蛋白尿。
3、考虑为遗传性肾炎。
4、考虑为弥漫性病变，如各型肾小球肾炎、肾病综合征、全身性疾病如系统性红斑狼疮、过敏性紫癜等引起的肾脏损害。
5、肾功能不全者，尤其急性起病，疑为急进性肾炎时，应及早进行肾穿刺活检。
6、肾移植术后等。这些均为肾活检指征。
总之，儿童肾穿刺活检还是相对安全，只要认真做好术前准备、掌握好适应证，术后认真调理。但是肾活检会给肾脏带来新的创伤，所以建议在可能的情况下儿童尽量不要做肾穿刺。
