由于再生障碍性贫血是一种复杂的血液疾病，所以在治疗上都是需要花费巨大的努力的，一般来说对于一些严重的血液疾病在治疗的过程中需要遵循几个原则问题，只有按照规定来治疗，才能起到事半功倍的效果，否则治愈的希望不大。
再障治疗的基本原则包括诊断和治疗期间所遇到的问题，标准包括以下几种：寻找致病原因，并及时进行隔离。如果没有出现严重的初学者则建议不要输血。一般血红蛋白在60克/升以下时，大多影响呼吸和循环功能，需要输血。慢性再障病程长，长期输血容易发生反应以致不能接受输血，或由于大量输血体内重要脏器积存过多铁，影响心、肝、胰腺功能，成为“血色病”，故输血应适当控制，避免不必要的输血。
由于再障患者易感染，所以要严防感染。定时清洁皮肤，根据感染部位及病因，应用适当的抗菌药物，如果白细胞计数很低，应用抗生素治疗效果不佳时可输用白细胞悬液或新鲜血，职出血严重，为防止脑出血可输给单采的血小板或新新血。
避免过量食用激素类药物，对不同病人可根据情况使用，但这些药物大多不能代替雄激素。而且这些只对慢性再障有一定的效果，对急性再障无效。
综上所述，患者在治疗的过程中应该严格按照医生的要求来做，对于一些常见的治疗方法，如输血和药物都要谨慎的使用，存在效果的同时也同样有很大的副作用。
