肾盂肾炎可分为急性和慢性两种，不同时期其症状也会有所变化。
急性肾盂肾炎
全身症状：患者大多起病急骤，常有39℃以上的高热、寒战或畏寒，全身不适、食欲减退、乏力、头痛，有时恶心或呕吐等。轻症患者可无全身表现。
尿路系统症状：尿急、尿频、尿痛等膀胱刺激症状是患者最突出的表现，每次排尿量很少，时有尿淋漓，大部分患者有腰痛或向会阴部下传的腹痛。
慢性肾盂肾炎
近年来提出肾盂肾盏有瘢痕形成，静脉肾盂造影可见肾盂肾盏变形、积水、肾外形不光滑，或二肾大小不等，被称为慢性肾盂肾炎。
患者症状比急性期轻，半数以上有急性肾盂肾炎的既往史，随后有低热、乏力、厌食和腰酸腰痛等症状，并伴有尿急、尿频、尿痛等膀胱刺激症状。
患者肾小管功能可有损害，如出现低渗、低比重尿，夜尿增多，浓缩功能减退和肾小管性酸中毒等症状。
肾性高血压很多由慢性肾盂肾炎引起，少数患者切除一侧病肾后，高血压会有所改善。
晚期患者可发生肾小球功能损害，氮质血症直至尿毒症。
