乙肝治疗如何选择方案需要根据病人的身体状况来定制，目前认为对慢性乙肝应采取综合治疗：抗病毒、免疫调节、改善肝功能和抗肝纤维化等，如何有效的进行乙肝抗病毒治疗是乙肝能不能治好的关键。乙肝抗病毒治疗目前应用的有α干扰素、核苷类药物和免疫调节剂如胸腺肽制剂等，但疗效均不够满意，治疗后乙肝病毒难以彻底清除，复发率较高。
影响乙肝抗病毒疗效的主要原因是乙型肝炎病毒（HBV）共价闭合环状DNA（cccDNA）难以彻底清除和人体对HBV的免疫耐受所致。所以，抗病毒的同时进行免疫调节，打破免疫耐受，对乙肝病毒的清除起到一定作用。
在乙肝治疗时，乙肝病毒异变也会降低抗病毒的效果。乙肝病毒异变可以造成免疫逃逸，病毒不易清除;同时病毒变异后，可引起耐药，均可降低乙肝抗病毒的疗效。乙肝治疗如何防止病毒异变让很多专家头疼，所以应选择适当方案，避免异变的发生。
