近年西医采用减少胃酸的西咪替丁或洛赛克及消灭幽门螺旋杆菌的阿莫西林、甲硝唑或克拉霉素来治疗胃窦炎，取得一定疗效。另外，还常用强化黏膜防御能力的硫糖铝或胶体次枸橼酸铋。为减少恶心、呕吐症状，一般还会加用吗丁啉。如果疗效欠佳，就需要采用中西医结合疗法。
由于胃窦炎是一种慢性病，所以中药对防治胃窦炎有较好的疗效，常用的有清热理气和调理脾胃的药，如蒲公英、黄芩、白芍、陈皮、乌药、山药、香附、延胡索、枳壳、木香、北沙参等。中成药有猴菇菌片、香砂六君子丸、胃复春等。以上药物可以根据医嘱酌量服用。
需要提醒的是，现在已有准确可靠的方法检测慢性胃炎的发病原因了，并可以进行针对性的治疗。所以尽管感觉孩子的症状是慢性胃炎，也最好不要在家给孩子自行用药，要及时到医院检查治疗，以免用药不当加重病情。
