CT在诊断早期转移及癌症局部扩散方面也存在一定局限性。
例如当怀疑有淋巴结浸润时，切除活检可发现微小的肿瘤病灶。淋巴结造影可显示淋巴结内细小的充盈缺损。而CT只能在淋巴结整体增大时才能显示出来。再如当前列腺癌结节局限于腺实质内时，直肠指诊就可以较准确地查出膀胱颈和精囊的浸润。而CT只有当癌结节较大，病变较复杂时，才可成为对癌肿进行分期的手段。
通过CT检查可以显示前列腺与周围组织结构的解剖关系
如癌肿对腺体外邻近组织的浸润及淋巴结肿大。正常前列腺CT扫描密度均匀，大小及腺体轮廓清晰，前列腺大小易于估计。
但CT不能准确的反应前列腺的内部结构，不能区分腺体与腺外包膜。虽然根据前列腺结节或不规则的边缘影像可提示前列腺癌，但并非特指，前列腺边缘光滑也不能除外癌。
因此，CT不能准确地区分良性前列腺增生与前列腺癌，亦不易区分A、B期病变。
由此看出，CT检查对前列腺癌的诊断只能起到辅助作用，只要在癌症的中期和晚期时，CT检查才可显示癌肿转移情况，可有助于确定肿瘤分期。
