传统治疗法
传染性软疣虽然可以自愈，但症状可能会持续数月至数年，因而适时的治疗以消除症状是患者的迫切要求，而软疣的传染及自我接种，主要原因是软疣小体内存在的大量， 因而治疗的关键即是消除软疣小体。
传统的治疗方法虽然能达到治疗目的，但每次均只能针对已成熟的损害,对一些小的或未成熟的疣体往往不能挑出或刮除，因而必须分次治疗，费时费力。
微波治疗法
微波是一种电磁波，微波治疗是利用电磁能的辐射，当微波进入人体时，可使组织内电解质偶级离子随微波频率变化而发生取向运动，在高速振动与转动过程中互相摩擦产生热效应，可使软疣小体凝固坏死而被消除，达到治疗目的。而且可以针对成熟及未成熟的软疣，一次性全部清除，明显缩短了治疗的周期。
国内资料显示微波对于多种皮肤病都行之有效。它与冷冻相比，不会形成张力性水疱，避免了继发性感染，患者的痛苦也小，易于接受，与电离子及2激光相比，不产生烟雾、无臭味、不出血，治疗层次清晰，提高操作时的能见度,深度范围易于控制，有效提高了治疗的精确性。在治疗过程中，焦渣易黏附于探头，需用生理盐水棉签或石蜡油棉签擦拭将其清除干净，以有利于观察皮损清除情况和观察治疗深度，另外在清除完疣体后，将探头与创面垂直方向。轻点创面，使之形成一凝固面，这样可避免创面感染并有利于创面的愈合。
