水瘊子或者说传染性软疣的经典治疗方法有一个专有名词——“挤疣”。目的是除去软疣内容物，破坏兜囊。
具体方法是这样的：在无菌情况下，用小镊子或止血钳将软疣夹破，挤出其内容物，或直接拔除较小的疣体，然后涂以5%碘酊或纯液体石碳酸或33%三氯醋酸（阴囊部损害禁用碘酊），同时压迫止血。
但是，此法痛苦较大，患者难以接受，尤其是儿童，损害较多者甚至不能坚持治疗。这时可不作挤疣治疗，而以口服中药汤剂为主。若发病时间较短者，当以清热解毒祛风为主，药用马齿苋合剂：马齿苋60g，大青叶15g，紫草、败酱草各10g。水煎服，每日1剂。若患病日久者，以养血解毒化瘀为主，药用治瘊汤：熟地15g，炒白芍、赤芍、丹皮、桃仁、牛膝、首乌、杜仲、赤小豆、炒白术、穿山甲各12g，生苡仁30g。水煎服，每日1剂。
同时，疣体处直接涂以碘酊或用中药煎汤外洗。外洗方：木贼草、香附、板蓝根、山豆根各30g，煎浓汤擦洗。其他如苦参、蛇床子、苍术、马齿苋等燥湿解毒，杀虫止痒之中药均可应用。
