到底什么时候进行抗病毒治疗才是“适时”呢？
在临床上，由乙肝病毒引起的免疫病理分为三个阶段，免疫耐受期、免疫清除期(又称病毒清除期)和病毒静止期。
免疫耐受期不主张治疗
在免疫耐受期，乙肝病毒在体内大量复制，但患者的免疫系统却像一头沉睡的狮子一样，既不能识别、又不能有效清除乙肝病毒。这个时候如果治疗，效果就会非常差。因此， 处于免疫耐受阶段的患者，一般不主张治疗，但要定期观察肝功能，寻找合适的抗病毒治疗时机。
病毒静止期以定期临床医学检测为主
在病毒静止期，肝功能正常，体内的病毒正处于一个静止期，没有复制，传染性也极弱。患者可以暂时不用治疗，但需定期到医院进行相关检查，以了解病情变化。必要时予以及时治疗，阻止病情进展。
免疫清除期为抗病毒治疗的最佳时机
在免疫清除期，肝功能反复异常。此期患者的免疫反应较好，患者体内有乙肝病毒复制，但同时机体也在积极地清除乙肝病毒，只是在清除的过程中，免疫系统会把带毒的肝细胞作为靶细胞进行破坏，因此会对肝细胞造成一定的免疫损伤，在检测肝功能时就会出现谷丙转氨酶增高的现象。此期为抗病毒治疗的最佳时期，临床往往能取得较佳的效果。
目前医学界的正规治疗都是把抑制病毒复制，从而控制肝炎活动作为治疗目标。一般来说，判断乙肝是否治好多以下4个标准来衡量：
一是没有乙肝病毒的活动性复制；
二是没有传染性；
三是肝脏无明显炎症；
四是病情稳定。
如果患者出现了以上四种特征，就可以说乙肝治好了，但这种“好”是相对的，乙肝患者仍需定期进行临床医学复查。
