一种观点认为，人工流产损伤了子宫内膜基底层，从而使子宫内膜无法再生。甚至造成永久闭经和终身不孕。
另一种假说则认为，人工流产之后的闭经是与人体激素调节有关，与哺乳期不来月经的原理相似：
孕酮是孕激素的一种，是人体天然分泌的孕激素。孕激素具有负反馈的调节作用，自身能够抑制自身分泌，而且也能够抑制雌激素的分泌。在正常未孕女性的整个月经周期里，排卵前的孕激素水平最低，排卵后开始上升，在黄体期为最高。排卵前，体液中的孕酮水平应当低于2纳克/毫升 ，排卵后则应当高于5纳克/毫升 。而如果怀孕，孕激素水平刚开始会停留在黄体期的水平，而当胎盘形成之后，胎盘所分泌的激素就会使孕妇体内的孕酮水平上升到100-200纳克/毫升，为未孕女性的几十倍到上百倍。因此得名孕酮。而由于孕激素的负反馈调节作用，当分娩之后，胎盘娩出，产后的妇女失去了胎盘这个激素源，体内的孕激素水平和雌激素水平就会骤然下降，导致哺乳期的妇女出现生理性的正常闭经。
而当人工流产之后，女性一下子失去了由胎盘供应的大量激素，导致体内的孕激素水平和雌激素水平骤然下降。故人工流产后的女性体内的孕激素水平和雌激素水平都会在一段时间内过低，导致暂时闭经。
