虽然10%～20%的健康妇女阴道中就携带有念珠菌，并且在生活中某些特殊情况下，如长期使用抗生素、患糖尿病等可以诱发阴道念珠菌感染，但很多时候霉菌性阴道炎也能够从外界感染而来。当妇女与念珠菌培养阳性的男性有性接触时，其被感染率为80%；与患有霉菌性阴道炎的妇女有性接触的男性中，约1/2的人会被感染。也就是说，霉菌性阴道炎可以通过性行为传播，这就是女方患霉菌性阴道炎时，其配偶也要同时接受治疗的原因。
另外，间接接触传染也是霉菌性阴道炎的一个传播途径。接触被霉菌感染的物体，如公共厕所的坐便器、浴盆、浴池坐椅、毛巾，使用不洁卫生纸，都可以造成传播，当被感染者外阴阴道的念珠菌达到一定数量时，即可发生霉菌性外阴阴道炎。
