碘是甲状腺合成甲状腺激素的重要的不可少的原料，甲状腺激素进人血液后对机体的某些组织和器官起着极为重要的作用，对人类的生命活动至关重要。因此碘摄入的多少也是对人体的生命健康起着重要作用。
成人碘缺乏会患甲状腺肿大、甲状腺功能减退、智能和体能低下等病症；儿童和青春期碘缺乏会影响其骨骼、肌肉、神经和生殖系统的生长发育；婴幼儿碘缺乏易患“克汀病”（呆小症）；孕产妇碘缺乏会影响胎儿的脑发育，严重者还会引起流产、胎儿畸形和死亡；胎儿期至出生后的三个月内是大脑发育的关键时期，此时碘缺乏将导致甲状腺衰竭，进而造成大脑功能出现不可逆改变。这种不可逆性智力低下，是碘缺乏所引起的最严重危害。
碘摄入量的增加可能出现轻度甲状腺功能亢进，它通常会发生在因长期碘缺乏而预先就存在功能性自主性甲状腺结节的病人身上。而明显的碘致性甲亢这一副作用，出现在严重碘缺乏人群并快速过量补碘后。“甲状腺癌增多与碘盐过量有关”的说法，并不准确。从全球范围看，近年来包括甲状腺癌在内的多数肿瘤都呈上升态势，但是甲状腺癌的发病机理迄今并不清楚，甲状腺癌与食盐加碘存在某种联系的推论依据不充分。相反，采取补碘干预可使甲状腺癌向低恶性转化的结论，已被广泛认同。
