一是不同孕期用药适应证常常不同;其次不同孕期用药时对胎儿的损害也有很大差别。以下仅就妊娠各期的用药予以简述。
1.妊娠早期用药
受精卵着床于子宫内膜前谓之着床前期。此期虽然对药物高度敏感，但如受到药物损害严重，可造成极早期的流产，如若受到部分损害，有时还有补偿功能，胚胎可能继续发育而不发生后遗问题。
故如在此期曾短期服用少量药物，不必过分忧虑。关键在于受孕后的3-12周左右，是胚胎、胎儿各器官处于高度分化、迅速发育阶段，药物影响此过程，可能导致某些系统和器官畸形。可见妊娠12周内是致畸最敏感的时期。故此期用药应特型慎重。
2.中期和晚期妊娠用药问题
妊娠的中晚期，药物对胎儿的致畸可能性减少。但此时的牙、神经系统和女性生殖系统还在继续分化发育，药物的不良影响主要表现在上述各系统、各器官发育迟缓和功能异常，此时期用药也应慎重，根据用药适应证权衡利弊做出选择。
3.妊娠期用药原则
单药有效的避免联合用药，有疗效肯定的老药避免用尚难确定对胎儿有无不良影响的新药，小剂量有效的避免用大剂量。
早孕期间避免使用C类、D类药物。若病情急需，要应用肯定对胎儿有危害的药物，则应先终止妊娠，再用药。
