现在约翰霍普金斯大学的研究人员认为一些头颈部的癌症，尤其是扁桃体的和舌以下区域的癌症同HPV感染有关。他们还发现HPV阳性的头颈部癌症的预后比较好，说明与其它的头颈部癌症不同。
Keerti V. Shah博士说， 通常头颈部癌症的预后不太好，大多数病人是在疾病晚期才发现的。但HPV阳性的癌症在显微镜下有明显的特征，所以病理学家能立即判断是否是HPV阳性的肿瘤。
在5月3日出版的国立癌症研究所杂志上，Shah博士及其同事发表了他们的研究报告。他们在253例头颈部癌症的病人中检测HPV。25%的病例中发现HPV，90%的HPV阳性肿瘤中还带有HPV16亚型，而这一亚型通常和子宫颈癌有关。
HPV阳性的肿瘤同HPV阴性的肿瘤有明显的区别。一方面在显微镜下有明显区别，另一方面HPV阳性肿瘤很少有P53基因的突变。在中重度饮酒者和吸烟者中，HPV阳性肿瘤要比其它类型的头颈部肿瘤少。根据这些特征，研究人员认为这种癌症可能同HPV感染有关。
HPV阳性肿瘤患者同其它肿瘤患者相比，死于癌症的可能性要少59%。这可能是HPV破坏组织的能力不如一些环境因素，如吸烟。另外，HPV阳性肿瘤对放疗更敏感。
在一篇评论中，哈佛大学的David T. W. Wong和Karl Munger博士认为高危的HPV相关的头颈部癌症可能同HPV相关的子宫颈癌相似但不等同。他们认为这一发现很有价值，因为这对头颈部癌症患者的诊断和治疗都有重要的意义。
