目前，病毒性心肌炎的治疗缺乏特异性。传统治疗主要包括休息，高蛋白质、高维生素饮食，提高机体免疫力，抗病毒，促进心肌营养和代谢，应用免疫抑制剂及免疫调节剂，以及抗心律失常等。
有学者尝试应用黄芪、牛磺酸、钙通道阻滞剂、血管紧张素转换酶抑制剂、血管紧张素受体阻滞剂等药物治疗，也取得了一定疗效。
一般而言，大多数患者经及时治疗后，能完全康复，但也有部分患者可能遗留心律失常等后遗症。约12.5%的患者会进展为扩张型心肌病，极少数患者会因心肌弥漫性炎症、坏死，进而发生急性心力衰竭、心源性休克或严重心律失常而死亡。
可采用中西医结合的方法，通过改善心肌组织局部微循环、防止心肌损伤、提高心肌活力、恢复心肌细胞功能，从而达到治疗心肌炎的目的。
