台湾消基会是在日前接获民众投诉，一名肾病症候群患者因不愿服用类固醇，转而接受诊所医师建议，服用有机锗胶囊，结果造成下肢肿胀、胃痛、解黑便等不适，病况恶化。
台北荣总毒物咨询中心药师张桂香也指出，今年也曾接获一名个案，因肌肉疼痛服用有机锗，在连续服用十七天后，不但疼痛未见改善，肌肉也出现刺痛感，经建议停药后，症状已改善。
虽然上述个案无法直接证实与有机锗相关，但台大医学院毒理研究所教授萧水银指出，日本风行一时的有机锗，曾被视为具有抗氧化作用，造成民众一窝蜂使用，却发生二十三人食用后出现肾衰竭，并有六人因而死亡。
有机锗毒性虽较无机锗低，但是，长期使用下来，毒性可能蓄积体内，破坏肾小管，引发肾衰竭及肌肉萎缩，甚至造成神经毒性。尤其市售有机锗产品未经过检测，她担心业者以廉价、毒性强的无机锗冒充有机锗，供民众食用，可能严重影响健康，造成中毒。
也有民众质疑，有机锗产品在市面上以健康食品流通，甚至由医师背书，大肆宣导有机锗的功效，却未见卫生主管机构列管动作。台湾“卫生署食品卫生处”指出，包括人参、灵芝等天然食品都含有机锗，如果业者将人参、灵芝磨粉制成胶囊使用，可视为一般食品管理。
医师虽可依病人病情需要，建议给予营养补充品，但是，“卫生署”未曾核准有机锗当成食品原料或营养添加物使用，医师未确认食品安全性前，擅自给予病患有机锗，已违反“食品卫生管理法”，“卫生署”也再三呼吁，有机锗的功效未明，且具有毒性，切勿擅自购服，以免受害。
