但是不同药性的中药，讲究不同的服药时机。一般而言，治疗虚症和肠胃病，应在饭前30~60分钟服用；而治疗心肺病和其他一般疾病，则通常在饭后30分钟服用为佳，以避免药物对肠胃产生刺激，减少副作用的产生；助消化或对肠胃有刺激的中药，也应饭后服用；而补益药和泻下通便的药物则宜饭前空腹服用。其中，通便药物如大黄、火麻仁等，宜在清晨或白天服用，避免在睡前或夜间服用；驱虫药也应在早上空腹服用，而安神药则应在睡前服用。
另外，“趁热喝”是大部分人喝汤药的习惯。其实，喝汤药不一定要“趁热”。中医理论认为，一般的中药汤剂应该“温服”，即药汤煎后立即滤出，在常温下放至30℃～37℃时再喝，而丸、散一类中成药也应该用温开水送服；属于解表、发散风寒的中药，才应该“热服”，并且可在服药后吃点稀饭、热水，以助药力；而止吐、解毒、清热的药，则应该“冷服”，以免引起刺激。
